管道运输合同纠纷案件在处理过程中，需要关注以下几个要点。首先，明确合同内容。合同是双方当事人意思表示一致的结果，合同内容应详细明确，包括运输方式、运输路线、运输费用、违约责任等。明确合同内容有助于在纠纷发生时，判断双方的权利义务。

    其次，查明事实真相。在处理管道运输合同纠纷案件时，要充分调查、收集证据，了解合同履行情况、运输过程中的问题以及双方是否存在违约行为。只有查明事实真相，才能为案件处理提供依据。

    再次，注意证据收集。证据是判断案件事实的重要依据。在处理管道运输合同纠纷案件时，要注意收集以下证据：合同文本、运输记录、运输费用凭证、违约行为证明、证人证言等。证据要真实、合法、有效，以便在法庭上发挥重要作用。

    此外，注重法律适用。在处理管道运输合同纠纷案件时，要准确把握相关法律法规，如中华人民共和国民法典第一百一十九条、第一百二十条等。根据案件具体情况，正确适用法律，确保案件处理合法、公正。

    在处理管道运输合同纠纷案件时，还需注意以下几点：

    调解与仲裁。在案件处理过程中，可以尝试通过调解或仲裁解决纠纷。调解和仲裁都是解决合同纠纷的有效途径，有助于双方当事人达成和解，降低诉讼成本。

    诉讼时效。根据中华人民共和国民法典第一百八十八条规定，合同纠纷的诉讼时效为三年。在处理案件时，要关注诉讼时效问题，避免因超过诉讼时效导致败诉。

    维护当事人合法权益。在处理管道运输合同纠纷案件时，要充分考虑双方当事人的合法权益，确保案件处理公正、公平。

    最后，以下为相关法律依据：

    中华人民共和国民法典第一百一十九条：当事人订立合同，应当遵循自愿、等价、公平、诚实信用的原则。

    中华人民共和国民法典第一百二十条：当事人应当按照约定履行自己的义务，不得擅自变更或者解除合同。

    中华人民共和国民法典第一百八十八条：因合同纠纷提起诉讼的，诉讼时效期间为三年，自知道或者应当知道权利受到侵害之日起计算。

    中华人民共和国民事诉讼法第六十四条：当事人对自己提出的主张，有责任提供证据。当事人及其诉讼代理人因客观原因不能自行收集的证据，或者人民法院认为需要鉴定、勘验的，可以申请人民法院调查收集。