在农村自建房施工合同纠纷中，工程质量责任的认定与赔偿标准往往成为争议焦点。由于农村自建房多为个人与施工方直接约定，缺乏专业监理和规范合同，一旦出现墙体开裂、地基下沉、屋顶漏水等质量问题，双方对责任划分常各执一词。此时需结合施工资质、合同约定、验收记录等关键证据综合判断，既要保障农户合法权益，也要避免施工方承担不合理责任。

    工程质量问题的责任认定通常遵循谁过错谁担责原则。若施工方未按约定使用合格建材、擅自变更设计或明显违反技术规范导致缺陷，应承担主要责任；若农户自行提供劣质材料或强令违规施工，则需减轻施工方责任。对于隐蔽工程缺陷，施工方若不能证明已按标准施工且通过验收，推定其存在过错。特殊情况下，如房屋倒塌等重大质量问题，可能涉及刑事责任，需移送司法机关处理。

    赔偿标准的确定需考虑实际损失与修复成本。对于可修复的质量问题，一般以合理维修费用为限，包括材料费、人工费等直接支出；若房屋存在结构性缺陷无法修复或修复成本过高，可参照重建成本与房屋现值差额计算损失。同时，因质量问题导致农户临时租房等间接损失，若施工方事先知情或应当预见，也应予以赔偿。部分地区还会结合当地经济水平和行业惯例调整赔偿金额，确保裁判结果公平合理。

    纠纷解决过程中，协商调解应作为优先途径。乡镇司法所、人民调解委员会可组织专业评估，促成双方达成维修补偿协议。若进入诉讼程序，法院通常委托专业机构进行质量鉴定，并根据过错程度划分责任比例。值得注意的是，农户自建房若用于经营且施工方明知用途，赔偿范围可能扩大至经营损失，但需提供充分证据证明损失与质量问题的因果关系。

    法律依据：中华人民共和国民法典第七百七十条规定承揽人应按照定作人要求完成工作并交付成果；第七百八十一条明确承揽人交付的工作成果不符合质量要求的，定作人可要求修理、重作或减少报酬；最高人民法院关于审理建设工程施工合同纠纷案件适用法律问题的解释（一）第十二条规定承包人拒绝修理、返工或改建，发包人可请求减少支付工程价款；建筑法第六十二条明确建筑工程实行质量保修制度，保修范围包括地基基础、主体结构等关键部位。